ترجع بداية القسم إلى عام 1978 م وكان يسمى تكنولوجيا الانشاءات, ثم تم تقسيمه إلى قسمى الهندسة المعمارية والهندسة المدنية فى عام 1987 م, وتوالى على رئاسة القسم تسعة رؤساء هم:

تم استحداث قسم هندسة الحاسبات و النظم عام ١٩٩٨ كقسم علمى بناءًا علي موافقات مجلس الكلية ومجلس الجامعة و لجنة قطاع الدراسات الهندسية بالمجلس الأعلى للجامعات و القواعد المنظمة فى قانون تنظيم الجامعات، وتم ٳدراج اللائحة الداخلية لمرحلة البكالوريوس عام ٢٠٠٤ بعد زيارة اللجنة المشكلة لذلك من لجنة قطاع الدراسات الهندسية.

وتم قبول الدفعة الأولي بالقسم فى العام الجامعي ٢٠٠٥/٢٠٠٦ وكان عدد طلابها ثلاثون طالبًا و منهم الأول علي الثانوية العامة بقطاع الصعيد و الأول على دفعة الفرقة الٳعدادية. وقد تم تخريج أربع دفعات من القسم حتى الآن، ويعمل خريجى القسم فى أماكن متميزة سواء في الجامعات أو المراكز البحثية.

على سبيل المثال:
  • ثمانية معيدين بقسم هندسة الحاسبات و النظم – جامعة المنيا
  • باحث بجامعة Lund بالسويد
  • باحث بجامعة التاى التكنولوجية بمدينة ناؤول- روسيا الاتحادية
  • عضوان ببرنامج فيرجينياتك لمدة عامين – الولايات المتحدة الأمريكية

كما يعمل خريجي ا لقسم بشركات شهيرة مثل: (Valeo, Mentor graphics, RDI, IT works, IBM Egypt)